Editorial
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Dossier - Transkriptom-Analyse

Transkriptom-Analyse

Die Sequenzierung von Transkriptomen ist inzwischen Routine. Viel kniffliger ist es, die einzelnen Transkripte in Zellen und Geweben exakt zu lokalisieren.

NGS-Library-Präparations-Kits

NGS-Library-Präparations-Kits

Die Herstellung von NGS-Bibliotheken ist einer der größten Kostenfaktoren bei der Sequenzierung von DNA oder RNA. Mit modifizierten Kits und eigenen Protokollen ... mehr

Exakt verortete Transkripte

Exakt verortete Transkripte

In den letzten zehn Jahren machte die Einzelzell-Analyse erstaunliche Fortschritte. Ihr neuester Coup ist die räumlich aufgelöste Transkriptomik, ... mehr

Es kommt auf jede einzelne Zelle an – Einzelzell-Transkriptomik

Es kommt auf jede einzelne Zelle an – Einzelzell-Transkriptomik

Ein Barcode für jede Zelle – auf diesen einfachen Nenner könnte man moderne Methoden der Einzelzell-Transkriptomik bringen ... mehr

mn-Seqeuncing-by-Synthesis - 100-Dollar-Genom mit rotierender Scheibe

mn-Seqeuncing-by-Synthesis

Sequenzierkosten von einem Dollar pro Gigabase – das verspricht das im Juni aus dem Tarn-Modus aufgetauchte Start-up Ultima Genomics ... mehr

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Q2 EVOLVE epromo von INTEGRA

Gewinnen Sie ein limitiertes, individuell bedrucktes EVOLVE-Starterpaket mit manuellen Pipetten von INTEGRA mehr

Next und Third Generation Sequencing

Next und Third Generation Sequencing

20. August 2021. Heute schwimmt ein Fetzenfisch über die Titelseite von Science Advances und kündet von der ersten De-novo-Genomsequenz ... mehr

Editorial

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Welche Pipettiertechnik passt am besten zur Anwendung?

Luftpolsterpipette oder Mehrfachdispenser – mit den Systemen von BRAND treffen Sie die richtige Wahl. mehr

Zusammenfassung aktueller Sequenziertechniken

Zusammenfassung aktueller Sequenziertechniken

In aller Kürze: Illumina - im Nahfeld: PacBio - im Kanal: Oxford Nanopore Technologies (ONT) - im elektrischen Feld: Genapsys - in der optischen Karte ... mehr

Sequenz-Konfetti oder Lese-Marathon RNA-Sequenzierung

Sequenz-Konfetti oder Lese-Marathon RNA-Sequenzierung

Die Short-Read-RNA-Sequenzierung ist derzeit die mit Abstand gebräuchlichste Methode für die Transkriptom-Analyse. Long-Read-Techniken lesen zwar ... mehr

Punktgenau gesteuerte Genexpression - Optogenetische Transkriptomik

Optogenetische Transkriptomik

Ein optogenetisches CRISPR-Cas-System ermöglicht die Aktivierung oder den Knock-down beliebiger Gene. Doch nicht nur das: ... mehr

Bioinformatik: Muster im Transkriptom

Bioinformatik: Muster im Transkriptom

Eine große Herausforderung für die Bioinformatik waren zuletzt die Daten aus Einzelzell-Analysen. Inzwischen gibt es Algorithmen, um aus Transkriptomen ... mehr

Transkriptom mit Ortsangabe

Transkriptom mit Ortsangabe

Eine neue RNA-seq-Technik macht die räumliche Verteilung des Transkriptoms in den einzelnen Zellen eines Gewebes sichtbar ... mehr

Langsam aber sicher

Langsam aber sicher

Bei der Nanoporen-Sequenzierung ist viel Finger­spitzengefühl beim Pipettieren gefragt. Einfacher geht es mit dem DIY-Pipettierautomaten SNAILS ... mehr

Sequenzieren mit Strichcode-Primern

Sequenzieren mit Strichcode-Primern

NGS-Bibliotheken während der reversen Transkription einen Barcode verpassen, ist recht umständlich. Einfacher geht‘s mit der BART-Seq-Technik ... mehr

Metabolische Sequenzierung SLAMseq

Metabolische Sequenzierung SLAMseq

Mit zwei simplen zusätzlichen Schritten wird aus der RNA-Sequenzierung eine Technik, die auch dynamische Veränderungen bei der Gentranskription aufspürt ... mehr

Datenanalyse mit dem Galaxy Server

Datenanalyse mit dem Galaxy Server

Das Freiburg Galaxy Team kümmert sich nicht nur um den europäischen Galaxy Server, der Biowissenschaftlern Zugang zu mehr als 1.500 ... mehr

RNA-seq-Tool BioJupies

RNA-seq-Tool BioJupies

Das freie Online-Tool BioJupies erleichtert Biologen ohne spezielle Bioinformatik-Kenntnisse die Analyse von RNA-seq-Daten. Herzstück des Programms ist ... mehr



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